故事发生在21世纪初期的中国北部湾海洋。主角南珠宝宝是海洋精灵，为守护黑珍珠、保护海洋和平，与海怪哥斯拉一伙斗智斗勇。该片以保护海洋、保护环境为主题，展现了人类对美好生活的珍爱和向往。在南珠宝宝的努力下，美丽的黑珍珠照亮了人们回家的路，也让人们从海上丝路出发，带着梦想走向世界。